1988年，学校设立档案科，编制3人，隶属于校长办公室。2001年，学校通过科技事业单位目标管理省部级认定。2010年，为适应学校事业发展需要，档案科更名为综合档案室。2013年，学校成立了以校长为主任委员，分管档案工作副校长为副主任委员，各部门、各学院分管档案工作领导为委员的档案工作委员会。同年，学校通过安徽省机关档案工作目标管理省一级考核认定。2022年，学校设立档案馆（校史馆），处级建制，下设综合档案室、档案收编室和史志编研室三个科室。

学校现有专职档案人员6名，全部具有大学以上文化程度， 1人具有高级专业技术职称，4人具有中级专业技术职称。全校各职能部门兼职档案员47人。

档案馆馆舍建筑面积2500平方米，设有办公用房、业务用房、档案库房。其中档案库房12个，库房建筑面积2000平方米。库房内安装了恒温恒湿空调系统、通风换气的新风系统，配备了高压细水雾灭火系统、火灾自动报警系统、档案库区安装门禁管理系统，每个库房及走廊都装有动态视频监控系统。

学校档案馆馆藏始于1978年，有1个全宗，馆藏量为56758卷，33832件，纸质照片档案3854张，数码照片63171张，视频资料373.69GB,实物档案1036件，其中永久档案17806卷，11520件，长期（或30年）档案19981卷，7282件，短期（或10年）档案18971卷，15030件，包含党群、行政、教学、科研、基建、财会、外事、学生、出版、设备、招投标、声像、实物13个档案门类。学校于2016、2020年、2023年、2026年先后开展了四期纸质档案全文数字化扫描工作，对除会计凭证和报表外的所有永久和长期纸质档案进行了全文数字化扫描。（截至2026年5月底）